TargetScan数据库

TargetScan是一个用于预测微小RNA（miRNA）和mRNA相互作用的数据库和工具。miRNA是一类非编码RNA分子，可以通过与mRNA互补配对来调控基因表达。TargetScan通过分析miRNA和mRNA序列的互补性，预测出可能的结合位点，并进一步预测miRNA与mRNA的相互作用。

TargetScan的数据库包含了多种物种的miRNA和mRNA序列信息，如人类、小鼠、果蝇、斑马鱼等。它将已知的miRNA和mRNA序列与基因组数据进行比对，找出可能的结合位点。根据这些位点的位置、互补性和其他特征，TargetScan通过计算预测它们的相互作用的可能性。

TargetScan的使用方法相对简单。首先，用户需要提供miRNA和mRNA的序列信息，可以是已知的miRNA和mRNA序列，也可以是用户自己的序列数据。然后，用户将这些序列输入到TargetScan的在线工具中，系统将自动进行计算和预测，并返回预测结果。

TargetScan的预测结果以表格的形式展示，包括miRNA的名称、mRNA的名称、结合位点的位置和其他相关信息。用户可以根据这些结果进行进一步的研究和分析。此外，TargetScan还提供了一些功能用于进一步分析结果，如查找共同的miRNA靶点、预测miRNA调控的功能通路等。

TargetScan已经被广泛应用于生物医学研究领域。例如，研究人员可以利用TargetScan预测miRNA和mRNA的相互作用，进一步探究miRNA在基因表达调控中的作用机制。另外，TargetScan还可以帮助研究人员鉴定潜在的miRNA靶点，从而发现新的生物标志物或治疗靶点。此外，TargetScan还被广泛应用于疾病研究中，用于研究miRNA在疾病发生和发展中的作用。

总之，TargetScan是一个功能强大的miRNA和mRNA相互作用预测工具。它可以帮助研究人员快速准确地预测miRNA和mRNA的相互作用，进一步研究miRNA在基因表达调控和疾病发生中的作用。通过使用TargetScan，研究者可以更好地理解基因表达调控的机制，并为疾病的诊断和治疗提供新的思路和方法。

参考文献：

1. Agarwal V, et al. (2015) Predicting effective microRNA target sites in mammalian mRNAs. eLife, 4, e05005.

2. Miranda KC, et al. (2006) A pattern-based method for the identification of MicroRNA binding sites and their corresponding heteroduplexes. Cell, 126(6): 1203-1217.

3. Lewis BP, et al. (2005) Prediction of mammalian microRNA targets. Cell, 120(1): 15-20. 如果你喜欢我们三七知识分享网站的文章， 欢迎您分享或收藏知识分享网站文章 欢迎您到我们的网站逛逛喔！https://www.37seo.cn/